珠海横琴新区地税局于2010年5月26日挂牌成立，是中央和省驻珠单位中第一个在横琴新区成立的职能部门。其主要职责是：负责珠海横琴新区范围内地方税纳税人税务登记以及应纳地方税、费的征收管理和日常检查工作。

珠海横琴新区地方税务局（正处级建制）现内设政务管理科、数据管理科、政策法规科、风险管理科（大企业管理科）、纳税服务科、党建办公室（廉政办公室）共6个职能科（室）。

成立以来,珠海横琴新区地方税务局在广东省地方税务局、珠海市地方税务局和横琴新区管委会的正确领导和大力支持下，紧紧围绕“以人为本、创新为先、文化为源、科技为重”的发展理念，努力发挥税收职能作用，服务横琴新区的开发建设。2017年组织税费收入83.48亿元，同比增长16.0%，实现了税收总量和税收质量的双提升。

成立以来，我局围绕横琴经济社会发展大局，秉承科学发展、先行先试的历史使命，明确打造“征管信息化程度最高的先行局、粤港澳税制紧密衔接的试验田、国地税资源高度共享的新平台”的发展目标，坚持依法行政，着力政策创新，强化税收征管，优化纳税服务，加强队伍建设，推进反腐倡廉和文化建设，积极承担省地税局绩效管理、征管改革和“一照一码”试点任务，全力推进行政审批制度改革，率先推出7类95项涉税事项即时办结便民办税服务承诺，推行“首次有税申报”，创新“智税宝”粤港澳智能导税创客平台、涉税事项“先办理后监管”模式和“互联网+税务”，打造“顾问式、提前介入式、不见面式、零距离式、客户式”五大套餐服务品牌，推出“粤港澳融合无差别”特色服务，营造法治化国际化的营商和政务环境。

随着横琴新区纳入中国（广东）自由贸易试验区，横琴新区迎来新一轮发展挑战和机遇。横琴新区局将紧紧围绕《横琴总体发展规划》和《珠江三角洲地区改革发展规划纲要（2008—2020）》，把握横琴新区作为“一国两制”下探索粤港澳合作新模式的示范区、深化改革开放和科技创新的先行区、促进珠江口西岸地区产业升级发展的新平台的功能和发展定位，紧抓自贸区建设机遇，发挥横琴地处粤港澳结合部的优势，抢抓改革发展的战略机遇，以“先行先试、改革创新”为核心，大力弘扬敢为天下先的创新理念，积极借鉴与探索港澳税制的有益经验，探索税收体制机制的创新，保持税收收入与经济发展同步的持续稳定增长机制，提升税收收入质量，逐步提高税收收入占GDP的比重，努力在构建有利于横琴新区发展的税收政策、管理体制机制、法治型和服务型政府、现代人力资源管理体系方面取得新突破，为开发横琴新区提供充裕的财力保障，为推进横琴自贸区建设发挥积极作用，为落实国务院把横琴建设成为“开放岛、活力岛、智能岛、生态岛”的发展战略作出地税部门应有的贡献。